Historia WhistlePig sięga 2007 roku, w którym to grupa przyjaciół postanawiła przejąć starą, 200-hektarową farmę mleczną w Shoreham, w stanie Vermont, z myślą o jej modernizacji i przekształecniu w destylarnię. W projekt zaangażował się Dave Pickerell - przez 14 lat pełniący rolę Master Distillera bourbona Maker’s Mark. Odnalazł on w Kanadzie spory zapas porzuconej 10-letniej whisky żytniej, pozwalający na zabutelkowanie pierwszych wersji WhistlePig.

Jesienią 2015 roku WhistlePig otworzyła własną destylarnię, której założeniem jest produkcja whisky od "pola do butelki", czyli od zbioru żyta, poprzez zacieranie, fermentację, destylację, leżakowanie, aż po butelkowanie.